- 注本草者，当先注明其所以主治之由与所以当用之理，使读之者有义味可咀嚼也。兹集药性病情，互相阐发，庶便资用。若每处皆释，则重复烦琐，反生厌渎，故前后间见。或因药论辨，读者汇观而统会之可也。
- 上自《神农本草经》，以至李氏《纲目》，俱递有收载。自《纲目》以后，收载绝少。如燕窝之类，用治甚多，从前俱所失收，兹集俱为增入。
- 自古本草以至近今本草，俱有是名，而今并无是药者，如预知子之类，俱为削去。
- 药品主治，诸家析言者少，统言者多。如治痰之药，有治湿痰者，有治燥痰者，诸书第以除痰概之；头痛之药，有治内伤头痛者，有治外感头痛者，诸书惟言治头痛而已。此皆相反之证，未可混施。举此二端，其余可以类推矣。又止言某病宜用，而不言某病忌用，均属阙略，兹集并加详注，庶无贻误。
- 每药先辨其气味、形色，次著其所入经络，乃为发明其功用，而以主治之证，具列于后。其所以主治之理，即在前功用之中，不能逐款细注，读者详之。
- 徐之才曰：“药有宣〈上升下行曰宣〉、通、补、泻、涩、滑、燥、湿〈即润也〉、轻、重十种，是药之大体，而本经不言，后人未述。凡用药者，审而详之，则靡所失遗矣。”今为分阐，以标于本药之上〈此十剂也，陶隐居多寒热二剂，兹不具述。然本集燥剂，即陶氏之热剂；而通剂，乃徐氏之燥剂也〉。
- 药品主治已注明某脏某腑者，则不更言入某经络，以重复无用也。
- 阴、阳、升、降、浮、沉，已详于药性总义中，故每品之下，不加重注。
- 采用诸书，悉标其名氏，使知为先哲名言，有可考据也。间有删节数行数句者，以限于尺幅也。有增改数句数字者，务畅其文义也。其间广搜博采，义图贯通，取要删繁，词归雅饬，庶几爽观者之心目云尔。
- 凡假药不可不辨。如花草子、伪沙苑、蒺藜、香栾、伪枳实、枳壳之类，始则以伪乱真，渐至真者绝少，数百年来从无人起而指摘者。此类甚多，兹集俱正其误。
- 同是药名，而力量厚薄悬殊，性味优劣迥别。如野白术与种白术、并江西白术之类，至肉桂中洋桂，黄连中新山连，更害人之尤者也。兹集俱细为分别。
- 本药而杂别种在内用者，即不能取效。如肆中柴胡夹杂白头翁、小前胡、远志苗、丹参等于内，不细为拣去，不唯无益而反有害矣，亦断不可不正之。
- 药品脩治，必须如法。今肆中熟地黄用煮，菟丝饼加面之类。制治乖方，断不可用，俱为正之。
- 凡可以救荒者，收载稍繁，以其有裨于生成之实用也。
- 养生与治病。食物之宜否，关系非细，故收载不厌其繁。
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